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ChemOffice如何进行能量优化?

时间:2014/4/9 9:29:06 点击:

  核心提示:分子3D模型能量最小化(能量优化)是指获取结构最低能时的构象。1.例如乙烷,以下是乙烷某一构象时的分子模型。 能量为3.563 kcal/mole2.对其进行能量最小化后,乙烷自动变换为能量最低的构象...

分子3D模型能量最小化(能量优化)是指获取结构最低能时的构象。

1.例如乙烷,以下是乙烷某一构象时的分子模型。
  能量为3.563 kcal/mole
乙烷-ChemOffice如何进行能量优化?

2.对其进行能量最小化后,乙烷自动变换为能量最低的构象,交叉式!
  此时对应的能量为0.819 kcal/mole
乙烷-ChemOffice如何进行能量优化?

鉴于此,可以使用该功能对结构的稳定性进行判断。

下面做个示例,判断-OH和-CH3在同侧和异侧的两种同分异构体的稳定性。

3.首先通过右侧的ChemDraw建立3D分子模型。
Chem3D建立3D分子模型

4.然后进入Calculations下的MM2菜单,点击Minimize Energy进行能量最小化。
Chem3D-Calculations菜单

5.完成能量优化后,Chem3D会自动调节分子构象。
Chem3D能量最小化

作者:Admin 来源:原创


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